Surveillance du Sars-Cov-2 dans les eaux usées

Surveillance du Sars-Cov-2 dans les eaux usées - data.gouv.fr

Créé le 20 avril 2020, l’observatoire épidémiologique des eaux usées (OBEPINE) a permis de fédérer plusieurs projets de recherche ayant pour objectif commun de proposer un suivi macro-épidémiologique de l’épidémie de COVID-19 en analysant la présence du SARS-CoV-2 dans les réseaux d’assainissement. Financé par le Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l’Innovation, l’objectif du projet OBEPINE s’inscrit dans une démarche de recherche et d’action permettant un suivi épidémiologique de la population à partir d’un échantillon représentatif de 150 stations de traitements des eaux usées (réparties sur le territoire national). Cette démarche a reçu le soutien de trois académies (Académie des Sciences, Académie des Technologies et Académie Nationale de Médecine). Les travaux menés par OBEPINE à partir des résultats venant des différents laboratoires d’analyse conventionnés par l’observatoire, font l’objet d’un traitement mathématique qui permet à la fois de corriger des biais d’analyse, de limiter l’impact des précipitations, de rectifier les échelles et de générer un indicateur de tendance normalisé sur l’ensemble du territoire national. Toutefois, en raison du caractère innovant de ces mesures et méthodes, qui n’ont pas encore fait l’objet d’un processus de normalisation abouti, il convient de manipuler et d’interpréter ces indicateurs avec prudence en le croisant avec d’autres indicateurs épidémiologiques. En collaboration avec l’équipe Data-Plateforme Recherche Innovation (DaPRI) du ministère des Solidarités et de la Santé, ces estimations de tendances, produites deux fois par semaine sont mise à disposition des collectivités, des ARS, et préfectures en temps réel. Ces résultats encore préliminaires sont accompagnées d’un indicateur de confiance qui identifie les biais qui ont pu être pris en compte à ce jour dans les estimations (orages, dilution des eaux, mouvements de populations…). L’ouverture de l’indicateur à compter du 24 janvier 2021, après un embargo de quelques jours, s’inscrit dans la démarche de science ouverte et de transparence des données et de l’action publique, préconisées par le rapport “Pour une politique publique de la donnée” d’Éric Bothorel. Le consortium Obépine continue à travailler pour améliorer cet indicateur pour en faire un jumeau numérique de l’épidémie, il développe également des actions de recherche sur le SARS-CoV-2 dans les eaux usées: suivi des variants, infectiosité dans les selles et les eaux usées, évaluation du risque sanitaire dans les boues, complémentarité par rapport aux autres indicateurs, proposition de plan de suivi, protection de la conchyliculture…

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